В дно ТОЛЬКО на выдув. Фильтры засорятся в первые 2 недели и сосать не будет вообще.
Пыль оседает у небя на столе, соотв в первую очередь будет собираться у тебя в системнике.
Но ИМХО: На дне куллер абсолютно не нужен, т.к. внизу воздух не сильно нагреваеться и с практической стороны и выдув и вдув - не оправдывают себя.
Лучше на верхнюю стенку вставь один на выдув. а на вдув либо на боковую, либо на лицевую.
Соотношение вдув\выдув должно быть 1:1. Т.е. количество кулеров на вдув долно равняться количеству кулеров на выдув. Можно +,- 1
ну, внизу более холодный воздух. вот он будет вдувать более холодный воздух и гнать его вверх. по поводу пыли. можно попробовать приделать "короб" который будет выходить из под дна -> пыли должно быть меньше. сверху вентиль уже есть....